Categoria: BATXILLERAT

Comentaris exercicis 3, 4 i 5 síntesi proteïnes

Els tres exercicis que ens faltava comentar són els següents:

Exercici 3:

  1. Químicament els aminoàcids són compostos orgànics caracteritzats per presentar, com a mínim, un grup amino bàsic (–NH2) i un grup carboxil àcid (–COOH).
  2. Que unes molècules siguin amfòteres significa que en medi àcid es comporten com a bases i en medi bàsic com a àcids.
  3. Hi ha vint aminoàcids diferents.
  4. Al C Alfa s’enllacen un grup amino (–NH2), un grup carboxil (–COOH) i un radical (R). El radical correspon a la cadena lateral que diferència cada aminoàcid

Exercici 4:

un tripèptid possible és Gly – Cys – Val

Tripèptid
Tripèptid

Exercici 5:

Pel què fa a la la seqüència de la molècula de la proteïna ribonucleasa, un enzim que trenca o hidrolitza les molècules d’ARN.

  1. La componen 124 aminoàcids.
  2. El nom i el símbol dels aminoàcids disposats en els llocs 1, 7, 22, 66 i 124 són respectivament: lisina(Lys), lisina (Lys), serina (Ser), lisina (Lys), valina (Val).
  3. En aquesta proteïna hi ha 6 residus de Lys (lisina) i 9 de Val (valina).
  4. La ribonucleasa conté 4 ponts disulfur establerts entre cisteïnes.

Enzims i activitat enzimàtica

Per ampliar continguts sobre els enzims, podeu fer servir els segünets enllaços:

[slideshare id=4516514&doc=tema6enzims-100616075821-phpapp01]

[kml_flashembed movie="http://www.youtube.com/v/VXNsr6Rc6ok" width="425" height="350" wmode="transparent" /]

[kml_flashembed movie="http://www.youtube.com/v/PILzvT3spCQ" width="425" height="350" wmode="transparent" /]

[kml_flashembed movie="http://www.lourdesluengo.es/animaciones/unidad8/reaccion_enzimatica.swf" width="500" height="450" wmode="transparent" /]

[kml_flashembed movie="http://www.lourdesluengo.es/animaciones/unidad8/inhibicion_enzimatica.swf" width="500" height="450" wmode="transparent" /]

[kml_flashembed movie="http://www.lourdesluengo.es/animaciones/unidad8/especificidad.swf" width="500" height="450" wmode="transparent" /]

[kml_flashembed movie="http://biomodel.uah.es/biomodel-misc/anim/enz/transition_state.swf" width="500" height="450" wmode="transparent" /]

[kml_flashembed movie="http://biomodel.uah.es/biomodel-misc/anim/enz/allosteric.swf" width="500" height="450" wmode="transparent" /]

Activitats dieta saludable, dieta equilibrada de CMC

Després de plantejar-nos inicialment els efectes dels hàbits en l’alimentació amb les activitats de SuperSizeMe, reflexionarem ara sobre l’efecte dels transtorns alimentaris a partir del visionat del programa 21 dies sense menjar, per acabar el bloc treballant sobre la nostra pròpia dieta.

Des d’aquest enllaç heu de baixar-vos les activitats en PDF, tot i que per a completar-les heu de començar fent un seguiment -i prenent nota al llarg d’una setmana- dels aliments que ingeriu al llarg del dia, com indica l’activitat número cinc.

Altra informació relativa les activitats:

[kml_flashembed movie="http://ntic.educacion.es/w3//eos/MaterialesEducativos/mem/nutricion/indice2.swf" width="500" height="450" wmode="transparent" /]

[slideshare id=954168&doc=alimentaci-i-nutrici-1232988030542575-1]

[slideshare id=1112224&doc=alimentacio-090306144545-phpapp01]

Roses digitals i lectures de qualsevol format

Rosa digital

Pel 23 d’abril -o per quan siga- a més de les roses orgàniques sempre fa comboi rebre i/o enviar una rosa virtual…. sobretot si la gent que l’ha de rebre està lluny 😉

Visca l’amor que m’ha donat l’amiga
fresca i polida com un maig content!
Visca l’amor
l’he cridada i venia
-tota era blanca com un glop de llet.

Visca l’amor que Ella també es delia:

visca l’amor:
la volia i l’he pres.

Joan Salvat-Papasseit

A sota us enganxe diverses adreces per enviar roses i recursos relacionats.

Rosa.cat
Rosa.cat

I per acabar, algunes propostes ràpides, per si no encara no sabeu amb que acompanyar les roses…

  • L’any de la Química a permés l’edició en català de l’espectacular The elements de Theodore Gray. Molt més que un recull d’imatges d’elements del nostre voltant.
  • Una lectura ràpida, amena i sempre curiosa és El Martell de deu d’Arthur C. Clarke. Ciència-ficció, realitat virtual, viatges a Mart,… i a més ens permet re-plantejar-nos el nostre lloc a l’Univers. A sota en teniu un tastet digitalitzat.
  • Per visualitzar clarament les causes d’aquesta darrera crisi, però amb un format àgil i gràfic com és el del còmic, la trilogia de Denis Robert El negoci dels negocis.

[kml_flashembed movie="http://www.musicadepoetes.cat/app/musicadepoetes/swf/mp3.swf" width="100" height="90" wmode="transparent" /]

[scribd id=7263332 key=key-hj9xoc7lzmy382zgut3 mode=list]

Aplicacions bioinformàtiques i proteïnes

Per anar enllaçant la unitat de proteïnes amb la d’àcids nucleics, anem practicant la relació entre codi genètic i protèic.

Ho farem a partir d’una pràctica de bioinformàtica i genètica de la UAB i -amb un nivell més avançat- de l’estudi de doctorat sobre bioinformàtica i proteïnes del IMB del CSIC. Per si algú vol idees per al treball de recerca 😉

Dels diferents exercicis i problemes relacionats amb l’ús d’eines bionformàtiques, heu de contestar les qüestions de l’exercici 1 per cercar informació sobre una seqüència coneguda d’ADN. I sobre l’estructura de les proteïnes, l’exercici 7 del curs on-line de l’IMB del CSIC.

Per contestar el primer exercici fareu servir el programa del NCBI Basic Local Alignment Search Tool BLASTn per cercar seqüències semblants a la problema. Teniu més informació sobre el programa ací o ací. Altra versió del programa més senzilla des de la Universitat de Kyoto.

Per al segon exercici haureu de visitar el portal Uniprot de l’EBI. Sobre proteïnes, també podeu consultar l’extensa base de dades del ExPASy o del BLASTp.

Pel mateix preu, teniu una repassada a les proteïnes i el codi d’una o tres lletres de les equivalències dels aminoàcids.

[slideshare id=1196975&doc=bioinformaticaproteinas-090325115928-phpapp01]

12 hores esportives al Can Vilumara

Avui al centre s’han dut a terme les 12 hores esportives 2011, treballades i suades des del curs 2001-02 pel departament d’Educació Física.

És una jornada lúdicoesportiva que té lloc durant tota una jornada lectiva del tercer trimestre, de les 8 del matí a les 8 del vespre. Els esports i categories són els mateixos que els de la lliga interna.

Ací teniu algunes fotos de l’activitat.

La química dels aminoàcids al Biology Project

Formació dun enllaç peptídic
Formació d'un enllaç peptídic

Per a poder formar els pròtids, com el dipèptid de la imatge de la formació d’un enllç peptídic de sobre, cal anar ensamblant els seus monòmers.

Per acabar d’ensamblar els vostres coneixements sobre els aminoàcids, us adjunte uns enllaços al portal The Chemistry of Amino Acids del Biology project .

A més de la informació sobre l’estructura i les diverses families d’aminoàcids, també podeu avaluar-vos a la secció de problemes o provar la identificació d’estructures o de codis. Teniu una figura amb els codis d’una i tres lletres.

I per anar fent goleta, un vídeo animat de la síntesi als ribosomes d’una proteïna a partir de l’ARN

Estructura bàsica dun aminoàcid
Estructura bàsica d'un aminoàcid

Protein synthesis from countingthoughts on Vimeo.

Protein synthesis from countingthoughts on Vimeo.

Continuen els moviments de terra al Japó

Escala dintensitat sísmica de la JMA
Escala d'intensitat sísmica de la JMA

Unes setmanes després del potent terratrèmol de magnitud 9 de l’11 de març passat a la costa pacífica de Tohoku, tornen els moviments per sobre de magnitud 7.

A hores d’ara s’ha desactivat l’alerta per Tsunami i aquesta vegada els efectes semblen menys impactants…

La intensitat del sisme serà, per tant, previsiblement menor. Per valorar-la si hi passeu alguna vegada, podeu fer servir l’escala d’intensitat sísmica de l’agència meteorològica japonesa (JMA), resumida en la imatge de la dreta o ampliada en aquest PDF.

Més informació en una entrada anterior sobre terratrèmols i dinàmica o en les xarxes de seguiment de sismes USGS o EMSC. També podeu seguir-ho via piulades en @QuakeReports

Activitat sísmica pel vols del Japó (1924-2008)
Activitat sísmica pel vols del Japó (1924-2008)


Presentació Un planeta viu. Per Selene i Judith

Ací teniu la presentació sobre Un planeta viu que Selene Liz i Judith Morenilla ens van exposar divendres passat… tot i que amb una mica de retard 😉

[slideshare id=7505984&doc=unplanetaviu-110404015549-phpapp01]