Categoria: Ciències

Gravetat musicada a l’Schoolhouse rock

The Tokens és un grup de doo-wop amb molts anys a l’esquena. Una de les seves composicions reuneix a Galileu i Newton, entre d’altres situacions quotidianes, per repassar els efectes de la gravetat.

La cançó és Victim Of Gravity i fou gravada el 1975 per a la sèrie Schoolhouse rock!.

Des d’aquest enllaç podeu accedir a les lletres de totes les cançons de la sèrie i al youtube trobareu una llista de repoducció amb la majoria d’elles.

[kml_flashembed movie="http://www.youtube.com/v/j8Y46S5OmGU" width="425" height="350" wmode="transparent" /]

Aplicacions bioinformàtiques i proteïnes

Per anar enllaçant la unitat de proteïnes amb la d’àcids nucleics, anem practicant la relació entre codi genètic i protèic.

Ho farem a partir d’una pràctica de bioinformàtica i genètica de la UAB i -amb un nivell més avançat- de l’estudi de doctorat sobre bioinformàtica i proteïnes del IMB del CSIC. Per si algú vol idees per al treball de recerca 😉

Dels diferents exercicis i problemes relacionats amb l’ús d’eines bionformàtiques, heu de contestar les qüestions de l’exercici 1 per cercar informació sobre una seqüència coneguda d’ADN. I sobre l’estructura de les proteïnes, l’exercici 7 del curs on-line de l’IMB del CSIC.

Per contestar el primer exercici fareu servir el programa del NCBI Basic Local Alignment Search Tool BLASTn per cercar seqüències semblants a la problema. Teniu més informació sobre el programa ací o ací. Altra versió del programa més senzilla des de la Universitat de Kyoto.

Per al segon exercici haureu de visitar el portal Uniprot de l’EBI. Sobre proteïnes, també podeu consultar l’extensa base de dades del ExPASy o del BLASTp.

Pel mateix preu, teniu una repassada a les proteïnes i el codi d’una o tres lletres de les equivalències dels aminoàcids.

[slideshare id=1196975&doc=bioinformaticaproteinas-090325115928-phpapp01]

La química dels aminoàcids al Biology Project

Formació dun enllaç peptídic
Formació d'un enllaç peptídic

Per a poder formar els pròtids, com el dipèptid de la imatge de la formació d’un enllç peptídic de sobre, cal anar ensamblant els seus monòmers.

Per acabar d’ensamblar els vostres coneixements sobre els aminoàcids, us adjunte uns enllaços al portal The Chemistry of Amino Acids del Biology project .

A més de la informació sobre l’estructura i les diverses families d’aminoàcids, també podeu avaluar-vos a la secció de problemes o provar la identificació d’estructures o de codis. Teniu una figura amb els codis d’una i tres lletres.

I per anar fent goleta, un vídeo animat de la síntesi als ribosomes d’una proteïna a partir de l’ARN

Estructura bàsica dun aminoàcid
Estructura bàsica d'un aminoàcid

Protein synthesis from countingthoughts on Vimeo.

Protein synthesis from countingthoughts on Vimeo.

Continuen els moviments de terra al Japó

Escala dintensitat sísmica de la JMA
Escala d'intensitat sísmica de la JMA

Unes setmanes després del potent terratrèmol de magnitud 9 de l’11 de març passat a la costa pacífica de Tohoku, tornen els moviments per sobre de magnitud 7.

A hores d’ara s’ha desactivat l’alerta per Tsunami i aquesta vegada els efectes semblen menys impactants…

La intensitat del sisme serà, per tant, previsiblement menor. Per valorar-la si hi passeu alguna vegada, podeu fer servir l’escala d’intensitat sísmica de l’agència meteorològica japonesa (JMA), resumida en la imatge de la dreta o ampliada en aquest PDF.

Més informació en una entrada anterior sobre terratrèmols i dinàmica o en les xarxes de seguiment de sismes USGS o EMSC. També podeu seguir-ho via piulades en @QuakeReports

Activitat sísmica pel vols del Japó (1924-2008)
Activitat sísmica pel vols del Japó (1924-2008)


Enllaços unitat 3 l’àtom 3r D

A sota teniu diferents enllaços a articles anteriors del blog,  on trobareu els continguts que hem de treballar a la unitat de l’àtom que hem començat.

[kml_flashembed movie="http://www.youtube.com/v/5pZj0u_XMbc" width="425" height="350" wmode="transparent" /]

Presentació Un planeta viu. Per Selene i Judith

Ací teniu la presentació sobre Un planeta viu que Selene Liz i Judith Morenilla ens van exposar divendres passat… tot i que amb una mica de retard 😉

[slideshare id=7505984&doc=unplanetaviu-110404015549-phpapp01]

Introduint les proteïnes i la seva estructura

Nivells estructurals de les proteïnes
Nivells estructurals de les proteïnes

Tot seguit teniu els objectius  i uns enllaços per introduir la unitat de les proteïnes. A sota de tot trobareu la primera tasca que heu d’elaborar.

Pel que respecta als objectius, en acabar la unitat haurieu de:

  • Diferenciar l’estructura comuna dels aminoàcids
  • Explicar com es forma l’enllaç peptídic
  • Explicar els diferents nivells d’organització de les proteïnes
  • Explicar com la seqüència d’aminoàcids determina la conformació tridimensional de les proteïnes
  • Relacionar els canvis estructurals causats per la desnaturalització de les proteïnes amb la pèrdua de la seva funció biològica
  • Raonar la importància biològica dels enzims
  • Explicar de manera clara i senzilla el mecanisme de l’acció enzimàtica
  • Conèixer alguns factors que modifiquen l’acció enzimàtica
  • Relacionar els efectes dels factors que modifiquen l’activitat enzimàtica amb les modificacions dels enzims a nivell molecular
  • Identificar, mitjançant proves de laboratori, proteïnes.

Per anar introduint el coneixement de les proteïnes i completar l’activitat Investigant proteïnes a la xarxa( PDF),  us adjunte un seguit d’enllaços: Continue reading Introduint les proteïnes i la seva estructura

Enllaços unitat 6 Moviment

Corredor de Peter Jansen
Corredor de Peter Jansen

A sota teniu alguns dels enllaços que farem servir en la unitat de Moviment que comencem.

Presentacions Salut i malaltia. Per Andrea&Olga i Christian&Àlex

Ací teniu les presentacions sobre Salut i malaltia que Andrea Peralvo & Olga Plou i Christian Unda& Àlex Ramos ens van exposar divendres passat.

[slideshare id=7493950&doc=salutimalaltia-110402135701-phpapp01]

[slideshare id=7493918&doc=salutimalaltia2003-110402135057-phpapp01]

Marie Curie 1867-1934. Exposició centenària a l’IEC

Cartell de lexposició
Cartell de l'exposició

Deixem de tèmer allò que hem après a entendre.

Dins els actes commemoratius de l’Any Internacional de la Química, i per recordar els cent anys que fa  que li van atorgar el Premi Nobel de Química del 1911, l’Institut d’Estudis Catalans (IEC) ha preparat conjuntament amb el parisenc Institut Curie una exposició sobre Marie Sklodowska, també coneguda per Marie Curie.

L’exposició s’inaugurarà el proper 6 d’abril -podeu descarregar el díptic de l’exposició-, i repassa la trajectòria de la cèlebre científica.  La mostra es podrà veure al pati de l’IEC fins a final del 2011.

Us adjunte uns enllaços sobre Pierre i Marie Curie i la biografia de la Marie al web dels premis Nòbel. Al blog del CRAI li han dedicat un parell d’apunts amb més informació sobre la seva vida i publicacions monogràfiques.