L’ATPasa mitocondrial i la fosforilació oxidativa

Els electrons de la glucosa s’han utilitzat per a crear un gradient electroquímic de protons entre l’espai intermembranós i la membrana mitocondrial interna.
L’ATPasa mitocondrial, actuant d’una manera anàloga a les turbines de les centrals hidroelèctriques, utilitza l’energia alliberada pel pas de protons a favor de gradient des de l’espai intermembranós a la matriu, per a sintetitzar ATP a partir d’ADP + Pi.
El següent vídeo, del Virtual Cell Animations Project, il·lustra molt bé aquest procés.
La manera com han representat l’ATPasa, encara que us pugui semblar difícil de creure, és bastant realista.
Gaudiu del vídeo.
Cordialment,
J

El transport d’electrons en la cadena respiratòria

Aquest fantàstic vídeo del Virtual Cell Animations Project, mostra de manera molt entenedora com té lloc el transport d’electrons a la membrana mitocondrial interna. Pareu-li atenció i gaudiu-lo:

JP

El cicle de Krebs

Recordeu que la primera fase de la degradació de la glucosa tenia lloc al citosol, i que a partir d’una molècula de glucosa (6C) obteníem 2 molècules de piruvat (3C).

La oxidació del piruvat ha de continuar en la matriu mitocondrial però, prèviament, es produirà la descarboxilació oxidativa del pir: s’allibera una molècula de CO2 i queda una molècula de 2 àtoms de C: l’acetat, que s’unirà a una molècula de CoA rendint Acetil-CoA.

L’acetil-CoA porta 2 àtoms de Carboni de la glucosa (un tercer àtom de C s’ha eliminat en forma de CO2), aquests 2 àtoms de C s’oxidaran en la matriu mitocondrial en el conjunt de reaccions que s’anomena “Cicle de Krebs”, “Cicle de l’àcid cítric” o “Cicle dels àcids tricarboxílics”.

Per a oxidar una molècula de glucosa caldran dues voltes completes del Cicle de Krebs, està clar, no?

Us adjunte unes animacions que us ajudaran a entendre el procés (cliqueu a sobre de cada diagrama).
Cordialment,
J

Glicòlisi

Recordeu, que:

  • La glicòlisi té lloc al citosol,
  • A partir d’una molècula de glucosa (C6H12O6) s’obtenen dues molècules de piruvat (CH3COCOO)
  • S’obtenen 2 molècules d’ATP
  • S’obtenen 2 molècules de NADH+ +H+

Aquesta animació us ajudarà a entendre i recordar els aspectes més importants:

Cordialment,

J

Introducció al disseny experimental

Us deixe un enllaç a uns documents realitzats per la Universitat de Girona on s’explica molt clarament en què consisteix el mètode científic i com s’ha de realitzar un disseny experimental.
Tots els capítols són interessants, però per a l’alumnat de 2n de batxillerat resulta d’especial interès l’apartat 4 del capítol I (El disseny experimental (II): aspectes pràctics), on s’explica clarament cóm s’ha de plantejar el problema que es vol estudiar, quina serà la variable independent, la dependent, la importància de controlar totes les altres variables, la necessitat de rèpliques i controls, etc.
Ací teniu l’enllaç:

http://dugi-doc.udg.edu/html/10256/3204/Introduccio-Disseny-Experimental-Practiques.htm

Cordialment,
Jesús Pedrós

Modelització de molècules

Benvolgudes, benvolguts,
tal i com us he comentat a la classe, us deixe l’enllaç a un servei de creació de models tridimensionals de molècules orgàniques:
http://biomodel.uah.es/model3j/inicio.htm
Si voleu instal·lar-vos algun programa de creació o visualització de molècules us recomane:
Rasmol per visualitzar (disponible tant per GNU/Linux com per altres sistemes operatius).
Si feu servir Ubuntu, simplement busqueu el programa amb el gestor de paquets Synaptic o al Centre de Programari de l’Ubuntu, on el trobareu sota l’apartat “Ciència”.
Per construir vosaltres mateixos les molècules (i després fer que el programa calcule la conformació tridimensional més estable): ghemical. Fàcil d’instal·lar des dels repositoris d’Ubuntu.
Si voleu més potència de càlcul (amb les dificultats que comporta l’aprenentatge d’una veritable eina de treball científic): Pymol. Disponible per GNU/Línux i altres sistemes operatius.
Us deixe amb un enllaç a la base de dades de molècules que faig servir aquests dies per a preparar els temes.
Cordialment,
Jesús Pedrós

D-Glucosa, amb Rasmol

D-Glucosa, amb Rasmol

La ciclació de la glucosa

En dissolució aquosa, les molècules de glucosa estan més del 90% del temps en forma de cicle.
Premeu el símbol de “play” per començar l’animació. En qualssevol moment podeu aturar-la prement el símbol de d’aturada.
Cordialment,
JP
[kml_flashembed movie="http://www.stolaf.edu/people/giannini/flashanimat/carbohydrates/glucose.swf" width="400" height="400" wmode="transparent" /]

Jo també he estudiat en la pública

http://www.yoestudieenlapublica.org/

Gàmetes de musclo (Mytilus sp.)

Materials:
Uns musclos frescos comprats al súper o a la peixateria.
Un microscopi òptic.
Porta, cobre, comptagotes.
Un telèfon mòbil amb càmera.
Ganes d’aprendre i gust per la feina ben feta.

Mètode:
Es combinen en l’ordre adequat els ingredients anteriors,
(cosa que el meu alumnat de batxillerat sap fer molt bé).

Resultats:
el vídeo que podem veure tot seguit.
L’òvul, “gran” i immòbil, a l’esquerra. Els espermatozous, a la dreta.

Gràcies a la Virgínia Costafreda per ensenyar-me a fer aquest tipus de preparació microscòpica. Gràcies, Ari, per treure el mòbil sense demanar-me permís, per realitzar la filmació i per facilitar-me-la.

La genètica de l’albinisme

L’albinisme és un trastorn d’origen genètic que resulta en manca de melanina als ulls, pell i cabell. Pot estar causat per mutacions en diferents gens, situats en cromosomes diferents:
– Una mutació recessiva al cromosoma X
– Una mutació recessiva al braç llarg del cromosoma 15. És la situació més freqüent.
– Una mutació recessiva al braç llarg del cromosoma 11. Aquesta mutació, quan es presenta en homozigosi, causa les formes més greus d’albinisme.
Us deixe amb una animació, que us pot ajudar a comprendre millor la malaltia, i amb uns enllaços per si voleu obtenir més informació:

podeu consultar:
Los Fantasmas de Tanzania, article de El Mundo on s’expliquen vessants humanes i socials de la malaltia, i d’on he extret l’animació.
http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=killing-albinos-tanzania-albinism
http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/ency/article/001479.htm
http://ca.wikipedia.org/wiki/Albinisme
http://www.albinismo.es/index.php?option=com_content&task=view&id=17&Itemid=33
http://www.albinism.org/publications/what_is_albinism.html

Cordialment,
JP