CSI amb BLAST: El cas de l’assassinat a l’aeroport.

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) és una potent eina del National Center for Biotechnology Information que ens permet comparar una seqüència de nucleòtids o d’aminoàcids utilitzant bases de dades que contenen el genoma i les seqüències d’aminoàcids de conegudes fins al moment de les proteïnes dels diferents organismes.

Amb l’opció “nucleotide blast” podem comparar l’alineament entre una seqüència de nucleòtids determinada i les seqüències que existeixen a les bases de dades.
Amb l’opció “protein blast” podem comparar una seqüència d’aminoàcids (utilitzant el codi d’una sola lletra per aminoàcid) amb les seqüències de totes les proteïnes que es coneixen fins al moment, de manera que, donada una determinada seqüència problema, és probable que puguem esbrinar de quina proteïna es tracta i a quina espècie pertany.
Així, amb aquestes eines, podeu saber a quina espècie pertany una determinada seqüència de DNA, o amb quina proteïna i de quina espècie es correspon una seqüència d’aminoàcids donada.
Per tal d’identificar una seqüència de nucleòtids us recomane l’enllaç del NCBI que us he ofert unes línies amunt.
Per tal d’identificar una seqüència d’aminoàcids us recomane la interfície MRS amb la base de dades “SwissProt”:

Amb el coneixement d’aquestes eines, sabríeu resoldre el cas de l’assassinat a l’aeroport?
Seguiu el següent enllaç i utilitzeu la vostra capacitat de deducció junt amb els vostres coneixements científics:
Murder at the airport.

Us deixe els documents relatius a aquest cas policial, traduïts al català, en format Open Document. (Els podeu obrir amb Libre Office / Open Office, podeu trobar aquests programes ací: http://www.softcatala.org/):
Document n1: descripció del cas i guia.
Document n2: les seqüències de proteïnes que s’han trobat a l’ampolla.
Cordialment,
Jesús Pedrós

Deixa un comentari

L'adreça electrònica no es publicarà Els camps necessaris estan marcats amb *