Arxiu d'etiquetes: microbiologia

Tot sobre la variant lambda de la covid: procedència, resistència a la vacuna i símptomes

Els investigadors afirmen que la variant peruana, considerada preocupant per l’OMS, s’assembla molt a la delta. La nova soca ja està a Espanya des de fa unes setmanes.

https://www.publico.es/ciencias/cambio-climatico-proximo-informe-onu-clima-contener-duras-advertencias-calentamiento-global.html

Todos los virus cambian y mutan con el tiempo y el SARS-CoV-2, el virus causante del covid-19, no es ninguna excepción. Al largo de este casi año y medio, este ha podido mutar y modificar sus características varias veces, y es por eso que ahora mismo existen muchas variantes: alpha, beta, delta… Pero, actualmente está creciendo otra que ha sido considerada de interés por la Organización Mundial de la Salud (OMS): la variante lambda.

Mientras la mayoría pone el foco en la famosa nueva variante delta, los expertos del Centro Nacional de Epidemiología están casi tan preocupados por la que podría ser la hermana gemela de esta, la denominada variante lambda (C.37), conocida también como andina o peruana. Y, aunque no sea tan conocida, según la GISAD, la plataforma mundial de seguimiento de las distintas cepas, España es el séptimo país del mundo con más casos provocados por esta variante, la cual está localizada en otros 31 estados. Y, aunque solamente se haya detectado una incidencia por debajo del 1% en Españasegún el Ministerio de Sanidad, esta variante podría ser tan contagiosa y evasiva a las vacunas como la delta. También, precisamente se está investigando si lambda está detrás de un brote de contagios de Cantabria que afectaría al menos a 80 personas.

Poca información

Lambda fue documentada por primera vez en Perú a finales del 2020 y, según los datos de la OMS, está detrás del 71,6% de los contagios en Perú, el 37% de los registrados en Argentina y el 32% en Chile, donde la vacunación masiva no ha podido frenar el impacto de esta cepa. Sin embargo, la propia organización reconoce que por ahora hay una “evidencia limitada sobre su virulencia y resistencia a la inmunidad”. Por lo tanto, aunque los datos señalan que sí, no está probado ni afirmado todavía si esta variante es más transmisible que otras variantes, si causa una enfermedad más grave o si vuelve menos efectivas a las vacunas: “No tenemos mucha información, en comparación con las otras variantes”, dijo Ricardo Soto-Rifo, virólogo de la Universidad de Chile que ha estudiado a Lambda.

Pablo Tsukayama, coordinador del laboratorio de Genética Microbiana en la Universidad Cayetano Heredia de Lima, forma parte de un equipo de investigadores cuyo trabajo fue crucial para detectar, medir y dimensionar a Lambda en un primer momento, cuando todavía se le conocía por su código de linaje: C.37. Según la última versión del estudio que la caracteriza (aún pendiente de revisión), Lambda apareció el 100% de las muestras de virus recogidas en Perú ya en abril de 2020. “Algo que no existía a fines de 2020 apenas, y que para marzo ya está en un 80%, quiere decir que probablemente tiene algún tipo de ventaja. Se expande rápidamente”.

Para conocer detenidamente los detalles entre elementos contextuales y atribuibles a la genética del virus, los investigadores tienen que seguir trabajando en ello: “Nosotros no hemos hecho esos cálculos todavía, en parte porque no hemos colectado suficientes secuencias aún. Estamos en ese proceso” afirma Tsukayama, “el mundo se ha acostumbrado a la evidencia rápida” añade.

Presuntas características de lambda

  1. Presenta mutaciones importantes en la proteína S, que podrían significar un mayor escape vacunal, incluso similar al de Delta.

  2. Los artículos pre-impresos de científicos brasileños también señalan que Lambda podría ser tan transmisible como Delta.

  3. Tiene mayor capacidad de transmisión que las otras variantes a las que prácticamente ha borrado del mapa en Sudamérica como la Gamma (sudafricana) o la Alfa (británica) y mayor escape, al menos, a la vacuna china CoronaVac.

  4. Preocupa su rápido crecimiento en Lima.

¿Esquiva la protección de las vacunas?

Entonces, es importante saber cómo de eficaz resulta a la hora de esquivar la protección con la que se dota nuestro sistema inmune mediante la vacunación. Pero, sobre esto, la evidencia es aún más escasa que sobre transmisibilidad. Hay apenas un par de estudios disponibles, ambos en condiciones de laboratorio.

Uno de ellos, dirigido por el virólogo chileno Ricardo Soto Rifo, se centró en la vacuna CoronaVac, del laboratorio chino Sinovac. En este se observó a un grupo de trabajadores de la salud voluntarios y encontraron que Lambda presentaba “capacidad de infección y de escape inmune incrementada versus los anticuerpos neutralizantes” que fomenta esta vacuna. Entonoces, el alcance fuera de laboratorio de dicha pérdida relativa, nunca completa, de protección está aún por ver.

En el otro estudio, un equipo de la Universidad de Nueva York comprobó reducciones similares para las vacunas de Pfizer y Moderna, que los autores consideraron como “relativamente menores”, pero también está pendiente de revisión científica.

Alerta, microtoxines! Prou treure només la part amb floridura dels aliments

De sobte t’adones que un parell de maduixes tenen una mica de floridura, les rentes, retires el fong de les que estan afectades i et menges la resta dels fruits. Vols preparar una bolonyesa i el pot de tomàquet que tens obert de fa un parell de dies s’ha florit una mica per dins; així doncs, treus el tomàquet que queda en “bon estat”, retires la floridura, i el fas servir per a la salsa. Són només alguns exemples del que fem, sovint, per no llençar menjar a la brossa. És cert que cal evitar el malbaratament alimentari, però… ho estem fent bé?

 “Menjar les restes d’un aliment florit és una mala idea i pot ser perjudicial per a la salut”, expliquen a l’ OCU, l’Organització de Consumidors i Usuaris“Els típics florits verds, blancs o tirant a negres que envaeixen els aliments són fongs que els colonitzen i es nodreixen a costa seva, i arriben a penetrar profundament al seu interior a través del miceli, unes ramificacions fines difícils de percebre a simple vista”, comenten. Continua la lectura de Alerta, microtoxines! Prou treure només la part amb floridura dels aliments

Regne Unit alerta de la possibilitat real d’una nova variant de COVID-19 que podria tenir una taxa de mortalitat del 35%

Segons l’informe publicat pel Grup Assessor Científic per a Emergències aquesta nova variant podria provocar la mort d’una de cada tres persones contagiades.

Reino Unido alerta de una nueva variante de COVID-19 que podría tener una tasa de mortalidad del 35%

A pesar de que la vacunación avanza, la lucha contra la pandemia no ve la luz al final del túnel. Continua la lectura de Regne Unit alerta de la possibilitat real d’una nova variant de COVID-19 que podria tenir una taxa de mortalitat del 35%

Els indígenes de la selva amazònica, acorralats pel Covid-19 i per una llei que intenta arrasar les seves terres

Suspesos els assajos en humans de la vacuna espanyola contra la covid

Aquest dimecres havien de començar els assajos en humans de la vacuna espanyola contra la Covid, però de moment hauran d’esperar.

El CSIC, que és qui la desenvolupa, frena de moment el procés perquè encara no ha rebut l’autorització de l’Agència Espanyola de Medicaments per administrar-la en persones. L’informe de l’Agència ha de valorar els últims assajos clínics que s’han fet amb la vacuna. El CSIC diu que desconeix per què s’ha paralitzat el procés.

L’Hospital de La Paz de Madrid estava reunint possibles voluntaris per fer les proves. La fase 1 preveia assajar el fàrmac en 112 voluntaris.

A la fase 2 es preveia avaluar els resultats d’immunogenicitat i la seguretat en 500 voluntaris.

Segons les previsions inicials, a la fase tres la vacuna s’havia de provar en 20.000 persones sanes abans d’acabar l’any.

El CSIC nega que l’aturada del procés tingui res a veure amb els efectes de la vacuna sobre els macacos utilitzats en la investigació. També desmenteix que un dels primats hagi mort pels danys pulmonars provocats pel fàrmac, tal com publiquen algunes informacions. Continua la lectura de Suspesos els assajos en humans de la vacuna espanyola contra la covid

Prediuen l’estructura del 98% de les proteïnes humanes utilitzant AI, una via per desenvolupar nombrosos tractaments

La intel·ligència artificial ha obert a la porta a un coneixement mai assolit fins ara de com són les proteïnes del cos humà, que són peces fonamentals de la vida.

L’estructura de cada proteïna –com es plega– defineix què fa i com ho fa, i és una informació importantíssima per entendre els processos biològics i fer avançar la investigació científica. Bàsicament, per comprendre com funcionen les malalties i desenvolupar medicaments.

Ara, el sistema d’intel·ligència artificial AlphaFold ha permès publicar la base de dades més completa i precisa que explica com es pleguen les molècules que formen les proteïnes, que tenen una forma tridimensional única.

El descobriment, publicat a la revista Nature, es considera un avenç científic comparable al desxiframent del genoma humà i un fort impuls per a la bioquímica.

És una base de dades oberta a la comunitat científica i que s’allotjarà a l’Institut Europeu de Bionformàtica (EMBL-EBI), que és qui ha desenvolupat AlphaFold juntament amb l’empresa DeepMind, companyia britànica que pertany a la matriu de Google, Alphabet.

https://blogs.publico.es/alberto-sicilia/2021/07/23/predicen-la-estructura-del-98-de-las-proteinas-humanas-utilizando-ai-una-via-para-desarrollar-numerosos-tratamientos/ Continua la lectura de Prediuen l’estructura del 98% de les proteïnes humanes utilitzant AI, una via per desenvolupar nombrosos tractaments

Lagarde avisa del risc de la variant delta per a la recuperació del turisme i l’hostaleria

La presidenta del Banc Central Europeu, Christine Lagarde, ha advertit aquest dijous que el ràpid augment dels casos de covid-19 a causa de la variant Delta és una font creixent d’incertesa per a l’economia de la zona euro.

Lagarde avisa del riesgo de la variante delta para la recuperación del turismo y la hostelería

La presidenta del Banco Central Europeo (BCE), Christine Lagarde, ha advertido hoy sobre la “sombra” que sigue proyectado la pandemia sobre la recuperación de la economía por la expansión de la variante delta del covid-19. La banquera central ha mencionado expresamente la hostelería y el turismo como dos de los sectores más afectados por la incertidumbre.

Continua la lectura de Lagarde avisa del risc de la variant delta per a la recuperació del turisme i l’hostaleria

El ‘long covid’ es converteix en la principal amenaça de la nova onada que assola Europa

Regne Unit registra gairebé un milió de persones afectades amb coronavirus persisteix en la vigília que el Govern elimini totes les restriccions.

 Els professionals comencen a detectar casos d’long-covid entre els joves i, segons detalla la investigadora Fàtima Méndez, presenten “la mateixa simptomatologia que el de 60 anys. De fet, en l’assaig clínic que està duent a terme el grup aragonès d’Investigació en Atenció Primària, dirigit per Rosa Magallón i Bàrbara Oliván, al costat de Fàtima Méndez, Alejandra Aguilar i Marimar Martínez, la pacient de menys edat afectada per covid persistent 16 anys. Aquesta investigació pretén conèixer les característiques socials i clíniques que s’associen a les persones amb long-covid enfront de les que superen la infecció sense conseqüències posteriors. A més, avaluaran l’impacte psicològic i en la qualitat de vida.

Continua la lectura de El ‘long covid’ es converteix en la principal amenaça de la nova onada que assola Europa

Cinc errors que fan de Catalunya el líder en contagis a Europa

Si s’haguessin mantingut i fins i tot restringit les mesures de seguretat del mes de juny, la gent hauria dit que eren unes mesures absurdes i innecessàries ? El Govern va subestimar la variant delta i ara reacciona tard davant d’una cinquena onada prevenible?

https://www.ara.cat/societat/cinc-errors-catalunya-pais-lider-contagis-europa-analisi-experts_130_4057315.html#

“Aquesta és la cinquena vegada que ens equivoquem i fracassem en la desescalada. La diferència és que ara teníem tots els elements per preveure i prevenir l’onada”, afirma el cap clínic de malalties infeccioses de l’Hospital de Sant Pau, Joaquin López-Contreras. La situació epidemiològica a Catalunya és crítica en termes de contagis i la pressió assistencial, preocupant. La Unió Europea desaconsella enèrgicament tant entrar al país com sortir-ne per la brutal incidència que registra (1.089 contagis per cada 100.000 habitants) i el conseller de Salut, Josep Maria Argimon, admet que el Govern hauria d’haver “reaccionat abans”: “Amb aquestes xifres, clarament no hem fet bé les coses”.

Anna Llupià, epidemiòloga a l’Institut de Salut Global de Barcelona (ISGlobal), recorda que “sortir en verd” al mapa europeu no és cap improvisació. “Ja ens van dir que el marc temporal de la pandèmia anava de 2 a 5 anys. La transmissió no s’atura sola”, destaca. De fet, els experts consultats advoquen per mesures quirúrgiques ràpides i severes per minimitzar danys i evitar les “mesures io-io”, que són més nocives per a l’economia i la salut de la població. L’investigador de la Universitat de Leicester Salvador Macip també lamenta que a les autoritats “els falti cintura” per decidir i fer una flexibilització de les restriccions prudent per por a perdre el turisme: “Amb el virus s’ha d’actuar per prevenció i no per reacció”.

” alt=”La incidència del covid a Europa.” data-v-5dde30c4=”” data-was-processed=”true” />

Aquestes són les cinc causes que han precipitat la cinquena onada catalana, un embat inèdit a Europa.

1. Una desescalada ràpida tot i l’avenç de la variant delta

Catalunya inicia la desescalada a principis de juny i en dues setmanes recupera les festes majors i les revetlles; aixeca el límit de 10 persones a les trobades socials, dona llibertat a la restauració per servir més comensals per taula i reobre l’oci nocturn. Alhora, Salut ja anuncia que la variant delta, una mutació que està posant contra les cordes països com el Regne Unit, representa el 20% dels contagis al país. En poques setmanes canvia les regles del joc: és molt més contagiosa que l’alfa (la britànica) i té més facilitat per transmetre’s per aerosols. “Amb variants anteriors segurament no tindríem una explosió de casos com l’actual”, admet Llupià.

Macip assegura que Catalunya va precipitar-se i va prendre “totes les decisions incorrectes” per viure una cinquena onada. Subratlla que aquesta variant és el principal factor que ha tornat a desestabilitzar bona part d’Europa, però recorda que al Regne Unit la virulència de la delta ja va demostrar el seu potencial per acarnissar-se amb els no immunitzats. Així, l’exemple britànic aconsellava ser prudent i evitar desescalar massa ràpid. En canvi, si a l’alta transmissibilitat del virus s’hi suma la reducció de mesures de contenció i l’augment de la interacció social, s’arriba a la “tempesta perfecta” perquè detoni una nova onada. Catalunya la va propiciar.

“Es va decidir continuar amb el pla de desescalada tot i que les previsions ja començaven caducades”, explica el metge, que diu que cap país europeu tenia excusa per reproduir els errors del Regne Unit i mentre “països com França ho van saber preveure, altres com Espanya i Catalunya, no”, conclou. També López-Contreras creu que es va subestimar l’amenaça d’aquesta variant. “L’error va tornar a ser veure un país veí passant-ho malament, menystenir-ho i tirar endavant amb els plans. I fins que no van esclatar els casos no veiem que la velocitat de contagi fa vertigen i que no s’assembla a res viscut fins ara”, lamenta.

2. Sant Joan prepandèmic i macrobrots de final de curs

La setmana de Sant Joan es diagnosticaven uns 450 casos a la setmana, hi havia mig miler de positius als hospitals i 179 a les unitats de cures intensives (UCI). “Fa sis setmanes teníem una de les millors tendències de l’epidèmia i això, més el bon ritme de vacunació, ens va fer confiar”, diu López-Contreras. Segons l’infectòleg, l’afartament social també hi va jugar un paper clau: “Vam fer més coses aquella setmana que els dos mesos anteriors i la bufetada ha estat espectacular”.

El repunt de contagis va començar a Barcelona i l’àrea metropolitana i amb una acceleració de les infeccions entre els més joves. D’una banda, la revetlla de Sant Joan és la primera festivitat que se celebra amb certa normalitat: encara que alguns municipis van tancar les platges, moltes discoteques reobren, tant als espais interiors com exteriors. “Que a l’estiu tindríem un problema amb els menors de 30 anys ho sabíem des d’abans que s’acabés el curs. Sant Joan no hauria d’haver-se celebrat”, afirma Macip.

L’altre factor van ser els viatges de final de curs. La barreja amb altres grups i un menor grau de compliment de les mesures de prevenció van afavorir l’expansió de macrobrots com el de les Balears, que van disseminar el virus com la pólvora entre els no vacunats. El conseller de Salut va entomar divendres el mea culpa i va lamentar no haver recomanat amb més insistència que es cancel·lessin aquests viatges.

3. Mascaretes fora, tant a l’aire lliure com als interiors

Juntament amb altres consellers d’arreu de l’Estat, Argimon demana en reiterades ocasions al govern espanyol que modifiqui el decret que obliga a portar mascaretes al carrer adduint que el risc de transmissió és molt inferior. La mascareta, deia Argimon, no era necessària a l’aire lliure si es podien respectar les distàncies. Finalment, la Moncloa n’avala l’eliminació i el president espanyol, Pedro Sánchez, detalla des de Barcelona que la norma decauria el 26 de juny, deu dies després d’aquest anunci sorpresa.

“En un pla de desescalada hi ha una part no escrita: allò què interpreta la gent. Treure’s la mascareta dona el missatge que la pandèmia s’ha acabat“, apunta López-Contreras, que sosté que aquest efecte no es va calibrar. “Si es portava la mascareta al carrer, t’asseguraves que es portava als interiors”, puntualitza.

També per a Macip l’error de les autoritats va ser la comunicació: “Era una decisió que s’havia d’explicar molt bé. Donaves peixet a la població perquè les coses anaven bé, però era perillós que es deixés de portar on tocava. I això és el que ha passat: no es va entendre bé i la gent n’ha prescindit en entorns de risc”. També hi coincideix Llupià: “Sempre hi ha molta confusió amb el discurs i les normes que s’emeten. La gent es pregunta: «¿Puc fer-ho?» en comptes de dir: «¿Si em protegeixo, puc fer-ho?»”

4. Aval als concerts i als festivals massius

La meitat dels brots d’aquest cinquè embat s’han registrat en l’àmbit social, és a dir l’oci nocturn, els concerts i els festivals. Així ho expressava el mateix Govern en la documentació amb què justifica davant de la justícia l’adopció del toc de queda per frenar la propagació del virus. En l’informe “queda demostrat” que en aquests entorns es dona majoritàriament l’incompliment de les mesures d’autoprotecció i seguretat, com l’ús de la mascareta i, tot i que “estaven molt ben organitzats”, Argimon va reconèixer que deixar fer els tres festivals previstos (Vida, Canet Rock i Cruïlla), amb més de 20.000 persones cadascun, va ser “un error”. “No ho repetiria”, va admetre.

PRESSIÓ HOSPITALÀRIA
” alt=”Pressió hospitalària a Catalunya a causa de la cinquena onada.” data-v-5dde30c4=”” data-was-processed=”true” />

Segons López-Contreras, la celebració de concerts i festivals era “una bomba de rellotgeria”. “Als assajos clínics tot surt genial perquè les condicions mai són idèntiques a la realitat. Amb la propagació que hi havia, crec que no es va aplicar el principi de prudència com caldria”, afirma. De fet, el mateix dia que començava el Cruïlla, el 9 de juliol, Salut assegurava a l’ARA que no es plantejava cancel·lar-lo malgrat l’evolució epidemiològica. Pocs dies després s’anunciava la intenció de demanar un toc de queda. “Posar restriccions just després de permetre uns festivals per a població jove, la que més es contagiava, resta credibilitat”, diu Macip, que afegeix: “Hem tornat a repetir l’error de solucionar problemes econòmics assumint riscos per a la salut”.

5. Sense planificació i excés de confiança en la vacuna

Quan el Govern inicia la desescalada només un 20% de la població estava vacunada del tot. Si bé el ritme d’inoculacions és alt i en un mes s’ha augmentat la xifra fins al 50%, Llupià qualifica de “fe desmesurada” la confiança de les autoritats en la vacunació. “Ens podem contagiar estiguem vacunats o no, de manera que canviar protocols d’aïllament perquè tinguis les dues dosis o avalar que la gent amb pauta completa vagi transmetent el virus és greu”, alerta. A mesura que el virus circula, hi ha més risc que muti i que es produeixi una variant que pugui escapar-se de la vacuna i “ens retorni” a la casella de sortida, segons Macip, que es pregunta si hi haurà una “variant catalana” després de l’explosió de casos. “La vacuna evita la mortalitat però no el contagi, no es poden eliminar les mesures de contenció de la nit al dia”, insisteix.

Tampoc no val qualsevol restricció perquè no totes responen al mateix objectiu. “Ara es vol reduir la pressió assistencial i els gestors tornen a posar el marc temporal dels 15 dies. Però cal planificació, anticipar-se als problemes i tenir una graella pública com fan Irlanda o Nova Zelanda, on es detalla la progressió de les mesures per a cada sector i es revisa cada 15 dies per adaptar-la a cada situació, com ara noves variants”, relata Llupià. Per a l’experta, abans d’aplicar mesures que poden resultar “massa cares” pels resultats que donen cal avaluar-les. “No sabem qui pren les decisions al Procicat. Hi ha moltes escletxes en la gestió i per intuïció no pots limitar drets fonamentals. És molt greu. ¿No estem veient la crisi institucional que se’n pot desencadenar?”, es pregunta.

Descobreixen un ‘superanticossos’ capaç de bloquejar les variants de la SARS-CoV-2 i altres coronavirus

L’S2H97 bloqueja l’ancoratge de tots els coronavirus assajats a la cèl·lula i s’ha mostrat eficaç per protegir hàmsters de la infecció per SARS-CoV-2.

Un equip de científics de Seattle i San Francisco han descobert un anticòs que no només actua contra diverses variants del SARS-CoV-2, causant de la Covid, sinó que també és efectiu contra altres coronavirus.

La recerca l’ha fet un ampli equip d’investigadors encapçalats per Tyler Starr, del Centre de Recerca del Càncer Fred Hutchinson de Seattle, amb altres col·legues del mateix centre i científics de Vir Biotechnology, una empresa amb seu a San Francisco. El treball ha estat acceptat per a la publicació a Nature i ja es pot llegir en aquest enllaç.

L’objectiu era estudiar un grup de 12 anticossos que Vir Biotechnology havia aïllat de persones que havien estat infectades amb el SARS-CoV-2 o amb el seu parent proper SARS, que va sorgir el 2003 al sud-est asiàtic i que provoca la síndrome respiratòria aguda greu.

Els autors van compilar una llista de milers de mutacions que es produeixen en la regió de SARS-CoV-2 que permet al virus unir-se a les cèl·lules que envaeix i que han donat lloc a diverses variants. Continua la lectura de Descobreixen un ‘superanticossos’ capaç de bloquejar les variants de la SARS-CoV-2 i altres coronavirus